Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VIRMAQ69YN4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
VIRMAQ69YN4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms