Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC092902.5-201ENST00000641650 3256 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ASPH-201ENST00000356457 3730 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
OBSCNQ5VST9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms