Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
STRIP1Q5VSL9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
STRIP1Q5VSL9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms