Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RPL39P5Q59GN2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RPL39P5Q59GN2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RPL39P5Q59GN2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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RPL39P5Q59GN2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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