Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DCAF6Q58WW2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DCAF6Q58WW2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DCAF6Q58WW2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DCAF6Q58WW2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DCAF6Q58WW2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms