Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL12Q53G59 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL12Q53G59 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms