Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4orf46Q504U0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4orf46Q504U0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms