Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC38Q502W7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms