Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ANKRD55Q3KP44 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ANKRD55Q3KP44 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms