Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL24A1Q17RW2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL24A1Q17RW2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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