Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NFE2Q16621 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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