Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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RPE65Q16518 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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RPE65Q16518 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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RPE65Q16518 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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RPE65Q16518 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPE65Q16518 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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