Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ASIC2Q16515 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ASIC2Q16515 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms