Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
USF2Q15853 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
USF2Q15853 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
USF2Q15853 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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