Protein–RNA interactions for Protein: Q15404

RSU1, Ras suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSU1Q15404 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RSU1Q15404 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RSU1Q15404 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms