Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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PUM3Q15397 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
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PUM3Q15397 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PUM3Q15397 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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