Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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