Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF4Q15306 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms