Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCOLCEQ15113 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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