Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDCD11Q14690 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms