Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
COL4A6Q14031 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms