Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNGB1Q14028 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms