Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PDE6HQ13956 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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PDE6HQ13956 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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PDE6HQ13956 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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PDE6HQ13956 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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PDE6HQ13956 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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PDE6HQ13956 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PDE6HQ13956 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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