Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CAPSQ13938 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms