Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTAN1Q13813 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPTAN1Q13813 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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