Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
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SHROOM2Q13796 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
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SHROOM2Q13796 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
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SHROOM2Q13796 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
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SHROOM2Q13796 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
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SHROOM2Q13796 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
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SHROOM2Q13796 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
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SHROOM2Q13796 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHROOM2Q13796 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SHROOM2Q13796 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
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