Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMAD4Q13485 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMAD4Q13485 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
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