Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IKZF1Q13422 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IKZF1Q13422 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms