Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLAMF1Q13291 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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