Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NME3Q13232 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NME3Q13232 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NME3Q13232 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NME3Q13232 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NME3Q13232 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NME3Q13232 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NME3Q13232 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NME3Q13232 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NME3Q13232 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NME3Q13232 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NME3Q13232 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NME3Q13232 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NME3Q13232 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NME3Q13232 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NME3Q13232 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NME3Q13232 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME3Q13232 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME3Q13232 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME3Q13232 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME3Q13232 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME3Q13232 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME3Q13232 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME3Q13232 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME3Q13232 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME3Q13232 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME3Q13232 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NME3Q13232 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME3Q13232 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME3Q13232 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NME3Q13232 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME3Q13232 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME3Q13232 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME3Q13232 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME3Q13232 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME3Q13232 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME3Q13232 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NME3Q13232 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NME3Q13232 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
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