Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN2BQ13224 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms