Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAPPAQ13219 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPPAQ13219 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPPAQ13219 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPPAQ13219 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPPAQ13219 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPPAQ13219 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPPAQ13219 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPPAQ13219 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPPAQ13219 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPPAQ13219 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPPAQ13219 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPPAQ13219 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAPPAQ13219 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAPPAQ13219 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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