Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SEMA3BQ13214 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA3BQ13214 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms