Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NR1H3Q13133 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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NR1H3Q13133 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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NR1H3Q13133 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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NR1H3Q13133 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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NR1H3Q13133 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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NR1H3Q13133 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NR1H3Q13133 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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