Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
GRIK3Q13003 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GRIK3Q13003 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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