Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GRIK2Q13002 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GRIK2Q13002 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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