Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXD4Q12950 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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