Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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PTPRJQ12913 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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PTPRJQ12913 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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PTPRJQ12913 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
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PTPRJQ12913 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
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PTPRJQ12913 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
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PTPRJQ12913 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PTPRJQ12913 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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PTPRJQ12913 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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PTPRJQ12913 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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PTPRJQ12913 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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PTPRJQ12913 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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PTPRJQ12913 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRJQ12913 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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