Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFCP2Q12800 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFCP2Q12800 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFCP2Q12800 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFCP2Q12800 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFCP2Q12800 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFCP2Q12800 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFCP2Q12800 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFCP2Q12800 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFCP2Q12800 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFCP2Q12800 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFCP2Q12800 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFCP2Q12800 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFCP2Q12800 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFCP2Q12800 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFCP2Q12800 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFCP2Q12800 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TFCP2Q12800 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFCP2Q12800 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TFCP2Q12800 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms