Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

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Length 1,436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP160Q12769 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP160Q12769 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP160Q12769 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP160Q12769 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUP160Q12769 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
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NUP160Q12769 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
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NUP160Q12769 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP160Q12769 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
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NUP160Q12769 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP160Q12769 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
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NUP160Q12769 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP160Q12769 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUP160Q12769 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
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NUP160Q12769 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP160Q12769 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
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NUP160Q12769 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NUP160Q12769 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUP160Q12769 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
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NUP160Q12769 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NUP160Q12769 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NUP160Q12769 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NUP160Q12769 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NUP160Q12769 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NUP160Q12769 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NUP160Q12769 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NUP160Q12769 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NUP160Q12769 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP160Q12769 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP160Q12769 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP160Q12769 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP160Q12769 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP160Q12769 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUP160Q12769 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
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