Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGNL1Q0VF96 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGNL1Q0VF96 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms