Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOBRQ0VD83 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms