Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms