Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNB2Q08289 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms