Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLEQ07864 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
POLEQ07864 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
POLEQ07864 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POLEQ07864 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLEQ07864 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLEQ07864 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms