Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABPB1Q06547 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms