Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DEUP1Q05D60 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DEUP1Q05D60 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms