Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CHRNB3Q05901 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms