Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIN1Q05586 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms