Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EMX2Q04743 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms